生产流程可溯源化是飞鹤乳业在2012年率先提出的企业服务，以数字化架构技术搭建的奶粉生产全流程可视化服务提高了全行业标准，目前，在产业链可溯源体系已经成为各大乳企标配的背景下，飞鹤奶粉将产业链可溯源体系再次升级，将数字技术与传统产业纵向结合，主动迈入数字化、智能化工业阶段，增强消费者与企业之间的连接关系，促进从供应链到生产端、再到消费端的良性循环，让飞鹤奶粉实现可持续增长。
飞鹤奶粉在北纬47度的黄金奶源带建立了“农牧工”三位一体的婴幼儿配方奶粉专属产业集群，通过完整的产业链率先达到了100％奶源自给率，保证了健康奶源供给，同时，飞鹤还通过设备自动化智能控制、数据采集系统和数据信息监控平台实现了符合数字化发展需求的智能制造模式，获得了集企业办公信息化、工业管理信息化、产品销售信息化于一体的数字化企业管理能力，能够让更多中国父母挑选到合适的奶粉，为中国宝宝健康成长持续助力。
当前，飞鹤旗下的克东智能工厂已经实现了精准到“0.1克”级别的精细化质量控制，以全自动智能管理系统实时监管飞鹤奶粉的每一道加工线路，打破以往人工投料精准度的局限性，实现生产效率34.57％的提升，工厂运营成本降低率也高达24.65％。除此之外，飞鹤还引进了WCM世界级制造管理体系，通过高标准的企业管理系统为企业提效减本，在提升飞鹤奶粉市场竞争力的同时向世界级乳品企业逐步迈进。
飞鹤奶粉将科研创新作为企业核心推动力，不断加大对于奶粉配方以及母乳研究投入，多年来在全国进行了大范围的母乳数控采集，以覆盖全国27个省份的2万份母乳研究样本建立了国内领先的专业级母乳数据库，在2021年首发了三大母乳研究成果，将婴幼儿奶粉行业的标准再次提升，深层助推了国内奶粉市场的升级发展。在数字化管理体系和生命科学研发的加持下，飞鹤奶粉将保持稳定发展速度，以消费者放心的健康品质全面助力国产奶粉市场稳步上升。